Meletakkan Dasar Pengetahuan Agama dan Umum, Kepribadian, Akhlak Mulia, Kecerdasan,serta Keterampilan untuk Hidup Mandiri dan Mengikuti Pendidikan Lebih Lanjut

Secara khusus tujuan pendidikan di MTs. Ma’arif Mandiraja adalah :

1. Memberikan pelayanan terhadap peserta didik serta  meningkatkan kualitas keilmuan dan amaliah keagamaan warga madrasah.
2. Mendidik siswa untuk menyakini kebenaran agama islam sesuai dengan paham Ahlul Sunah Waljamaah Wa Nahdiyah
3. Mengembangkan sikap perilaku yang mulia dalam kehidupan sehari – hari serta berwawasan kebangsaan
4. Meningkatkan kepedulian warga madrasah terhadap kebersihan, keindahan lingkungan madrasah
5. Meningkatkan kualitas dan kuantitas sarana prasarana dan fasilitas lain yang menunjang peningkatan prestasi akademik dan non akademik
6. Terwujudnya kerjasama yang harmonis dan dinamis antara warga sekolah, masyarakat dan dinas terkait